Görgü tanıkları, yüzlerce militanın Maiduguri kentinin birkaç noktasına saldırı düzenlediğini söyledi.
Kentte 24 saatlik sokağa çıkma yasağı ilan edildi ve sivil havaalanı da bir süreliğine kapatıldı.
Ülkedeki BBC muhabiri geniş çaplı ve eşgüdümlü saldırının Nijerya ordusu için ciddi bir darbe anlamına geldiğini söyledi.
Ülkede Boko Haram'ın şeriat için silahlı saldırılarına başladığı 2009 yılından bu yana binlerce kişi öldü.
Yerel bir yetkili, Fransız haber ajansı AFP'ye yaptığı açıklamada, "İki hava kuvvetleri helikopterinin yandığını" gördüm dedi.
Boko Haram örgütünün saldırıları nedeniyle kuzeybatı Nijerya'da olağanüstü hal uygulanıyor.
İslam devleti
Nijerya Cumhurbaşkanı Goodluck Jonathan geçen Mayıs ayında Boko Haram örgütüne karşı operasyon emri vermiş ve ülkenin kuzeydoğusunda olağanüstü hal ilan edilmişti.
Operasyonlar üzerine çok sayıda militan önce bölgeyi terk etti, ancak vakit geçirmeden intikam saldırıları düzenlemeye başladılar.
Boko Haram, yerel Hausa dilinde "Batılı eğitim haram" anlamına geliyor.
Örgüt, Nijerya hükümetini devirmek ve kuzeyde bir İslam devleti kurmak istiyor.