Futbol kariyerine Kamerun'un Cotonsport Garoua ekibinin alt yapısında başlayan Makoun, 2001'de Ligue 1 ekiplerinden Lille'e transfer olmadan önce, ülkesinin Jeunesse Star ve Tonnerre Yaoundé takımlarının alt yapılarında oynadı. Kısa zamanda takımın sürekli oyuncuları arasına giren Makoun, kulübüyle 150'nün üzerinde maça çıktı. 16 Haziran 2008'de Makoun, 14 milyon Euro bonservis bedeli karşılığında Olympique Lyon'a transfer oldu. Yıldız oyuncunun dünyanın dikkatini çekmesi ise 16 Şubat 2010'daki Real Madrid ile oynanan ve 1-0 kazanılan Şampiyonlar Ligi 1. turu ilk maçında, 47. dakikada takımının tek golünü kaydetmesiyle oldu...