Bazı gıdalar inflamasyonu arttırır. Bu gıdalar arasında rafine karbonhidratlar, kızartılmış gıdalar, işlenmiş etler, şeker, tatlandırılmış besinler, alkollü içkiler, şekerli gazlı içecekler, domuz eti bulunmaktadır. Hashimotolu hastaların bu besinlerden uzak kalması gerekmektedir.
İnflamasyonu azaltan ve aynı zamanda antioksidan gıdalara "anti-enflamatuar gıdalar" denir. Bunlar Hashimatolu hastaların tercih etmesi gereken gıdalardır. Bu besinler arasında kereviz, pancar, somon balığı, ceviz, brokoli, zerdeçal, zencefil, ananas ve koyu yeşil yapraklı sebzelerdir. Bu besinler aynı zamanda Omega 3 yağ asitlerinden den zengindir. Hashimotolu hastaların diyet programlarında önerilmektedir.