Cami’nin güneybatısında bulunan Hatuniye Medresesinin XIIIyüzyılda yapıldığı sanılmaktadırMedrese dikdörtgen planlı olup, giriş kapısının karşısında yuvarlak kemerli bir eyvan bulunmaktadır Avlunun iki tarafı kalın payeler üzerine oturtulmuş yuvarlak kemerli bir revakla çevrelenmiştir Bu revakların arkasında medrese hücreleri bulunmaktadır