Milli futbolcu Mustafa Pektemek 11 Ağustos 1988 yılında Sakarya ilçesi Akyazı’da doğdu. Okul takımı ile oynadığı turnuva sonrası 1999 yılında Topağaçspor altyapısına transfer olan futbolcu kariyerine genç yaşta başladı.
5 yıl bu takımda forma giydikten sonra 2005 yılında Akyazıspor’a transfer olan futbolcu bir sezon sonra Sakaryaspor altyapısına geçiş yaptı. 2006-2007 sezonunda gösterdiği performans ile dikkat çeken Mustafa Pektemek PAF takımdan A takım antrenmanlarına alındı ve profesyonel sözleşmeye imza attı. MKE Ankaragücü’ne karşı oynadığı maç ilk Süper Lig karşılaşması oldu.
2008’de Gençlerbirliği’ne transfer olan isim takıma uyum sağlayarak önemli oyuncular arasında yer aldı. 2011 yılında Beşiktaş’a geçen futbolcu sözleşmesini uzatarak 2016’ya kadar takımın formasını giydi. 2016’da İstanbul Başakşehir FK’ya transferi gerçekleşen futbolcu, U-19, U-21, A-2 ve A takım milli maçlarında oynadı.
Spor Toto Süper Lig 27. hafta maçında Galatasaray deplasmanda Medipol Başakşehir ile karşılaştı. Sarı-Kırmızılılar zorlu mücadelede Başakşehir'in Togolu yıldızı Emmanuel Adebayor'u durduramadı ve sahadan 4-0 mağlup ayrıldı. Adebayor Mayıs 2011'den beri ilk kez resmi maçlarda hat-trick yaptı. Başakşehir'in diğer golü 86. dakikada Mustafa Pektemek'ten geldi. Bu sonuçla Medipol Başakşehir 56 puana yükselerek Beşiktaş ile puan farkını 5'e indirdi. Igor Tudor'un öğrencileri ise 49 puanda kaldı ve 3. sırayı Fenerbahçe'ye kaptırdı.
Beşiktaş Teknik Direktörü Şenol Güneş'in, Pedro Franco'yu gönderme kararı aldığı öğrenildi. Hücum hattında ise Ömer Şişmanoğlu ya da Mustafa Pektemek’ten biriyle yolların ayrılacağı kaydedildi.
Mustafa Pektemek'in Beşiktaş ile anlaşamaması üzerine menajerinin Fenerbahçe ile görüştüğü öne sürüldü.
Konya’da oynanan Beşiktaş-Trabzonspor karşılaşmasında Belkalem ile çarpıştıktan sonra kanlar içinde yerde kalan Mustafa Pektemek’in annesinin sabrı tükendi...
Trabzonspor ile oynadıkları maçta burnu ve elmacık kemiği kırılan Beşiktaşlı Mustafa Pektemek, İstanbul yolculuğu öncesi havaalanında görüntülendi.
Beyaz Tv'de yayınlanan Beyaz Futbol adlı programda yorumculuk yapan Sinan Engin, Fatih Terim'e çağrıda bulundu.
Beşiktaş, ilk hazırlık maçında SC Verl'i 3-1 yenerken, Mustafa Pektemek sezona hattrickle başladı.
Yerli forvet transferinde Mevlüt Erdinç ve Elazığlı Deniz Yılmaz üzerinde yoğunlaştığı iddia edilen Fenerbahçe'nin Beşiktaşlı Mustafa Pektemek'i istediği iddia edildi.
Mustafa Pektemek, Franco ve genç kaleci Günay, gitmek için izin istedi.
Spor Toto Süper Lig'de Trabzonspor ile yaptıkları maçta sakatlanan Beşiktaşlı futbolcu Mustafa Pektemek'in, sağ ayak dış bağında total yırtık, ayak iç yan bağında ve tendonlarında da zorlanma tespit edildi. Pektemek'in Tromsö maçında oynayamayacağı belirtildi.