Emilia Clarke 26 Ekim 1986'da İngiltere'nin Londra şehrinde doğdu. Annesi işkadınıydı, babası ise bir tiyatroda ses mühendisliği yapıyordu. Clarke'ın kendinden başka bir de küçük erkek kardeşi var.
Clarke oyunculukla babası sayesinde üç yaşındayken tanıştı. Bir müzikal olan Show Boat'ı izledikten sonra oyuncu olmaya karar verdi. Oxford'daki St. Edward's School'dan mezun olduktan sonra Londra'nın prestijli oyunculuk okullarından Drama Centre London'a geçti. 
İngiliz aktris Drama Centre'daki dönemi boyunca on tiyatro oyununda rol aldı. 2009'da hem Company of Angels'ın sahnelediği Sense oyununda, hem de Samaritans için çekilen iki reklam filminde rol alarak profesyonel oyunculuğa başladı. 
Emilia Clarke, 2009'da İngiliz pembe dizisi Doctors'ın bir bölümünde konuk oyuncu olarak rol aldıktan sonra 2020 senesinde Syfy kanalında yayınlanan Triassic Attack filminde oynadı. 
İngiltere'nin en ünlü sinema dergilerinden biri olan ve aşağı yukarı 1889'dan beri faaliyet gösteren Screen International aynı sene içerisinde Clarke'ı "Birleşik Krallık'ın gelecek vaat eden yıldızları" arasında gösterdi. 
İngiliz aktris 2010 yılında HBO tarafından uyarlanmakta olan Game of Thrones dizisi için seçmelere katıldı. Rol için aslen The Tudords'daki Catherine Howard olarak hatırlayabileceğiniz Tamzin Merchant ile anlaşılmıştı, fakat Merchant işi bırakınca, Clarke tercih edildi. 
Clarke canlandırdığı Daenerys Targaryen karakteriyle 2011'de En İyi Yardımcı Kadın Oyuncu dalında EWwy Award kazandı, aynı zamanda 2013'te Emmy Ödülleri tarafından En İyi Yardımcı Kadın Oyuncu dalında da adaylık elde etti. Bunlarla bir olmaz ama, Askmen sitesinin okuyucuları da 2014 yılında kendini En Arzulanası Kadın olarak seçtiler, onu da ekleyelim. 
Clarke Game of Thrones çekilirken boş durmadı. 2012'de adını Stone Roses'ın meşhur konserini verdiği yerden alan Spike Island filminde ve Shackled adlı kısa filmde rol aldı. 2013 senesinde bunları başrolünde Jude Law ve Demian Bichir ile oynadığı Lionsgate filmi Dom Hemingway ile takip etti. 
2013 senesinde Audrey Hepburn'in meşhur ettiği Holly Golightly rolünü Breakfast at Tiffany's'in yeni Broadway uyarlamasında başarıyla canlandırdıktan sonra Clarke 2013'ün sonunda bir sonraki Terminator filminde Sarah Connor'ı canlandırmak için Paramount ile anlaştı. 
28 yaşındaki aktris, önümüzdeki yıllarda Voice from the Stone ve The Guns of August gibi filmlerde oynayacak. Aynı zamanda Terminator filmlerinde Sarah Connor rolünü yinelemek için kendisiyle anlaşıldığı da dile getirilenler arasında. Aynı zamanda Game of Thrones'un altıncı sezonu için de şimdiden kendisiyle el sıkışıldı bile. Anlayacağınız, daha Clarke'a doymadık, doymamız da gerekmiyor!
