Başsavcı Engin, ''Ergenekon'' soruşturması kapsamında, kendisi hakkında iletişimin tespiti kararı isteyen Adalet Bakanlığı müfettişleriyle ilgili hazırladığı şikayet dilekçesini Adalet Bakanlığına gönderdi.
Adalet Bakanlığı’nın 2008 tarihli kararıyla, İstanbul Cumhuriyet Başsavcısı Aykut Cengiz Engin’in de dinlendiği belirlenmişti. Aynı zamanda Ergenekon soruşturmasını da yöneten Engin’in, ev iş ve cep telefonu numarasının da dinlendiği öğrenilmişti.
Dinlemenin ortaya çıkmasının ardından Adalet Bakanı Sadullah Ergin'le görüşen Başsavcı, Adalet Bakanlığından belge istediğini açıklamıştı.
Engin'e ait ses kayıtlarının suç unsuru taşımaması üzerine imha edildiği de bildirilmişti.